40强赛全部战罢，12强赛的名额也是水落石出。日本、韩国、澳大利亚、伊朗、沙特以及乌兹别克斯坦均以头名晋级，此外卡塔尔和泰国也是拿到C组和F组的头名。叙利亚、伊拉克、阿联酋和中国则是以4个成绩最好的小组第2晋级，而中国队的晋级也得益于菲律宾、澳大利亚以及伊朗3队的帮忙。
12强球队：1.沙特（A组）、2.澳大利亚（B组）、3.卡塔尔（C组）、4.伊朗（D组）、5.日本（E组）、6.泰国（F组）、7.韩国（G组）、8.乌兹别克斯坦（H组）9.叙利亚（E组；12分）、10.伊拉克（F组；12分）、11.阿联酋（A组；11分）、12.中国（C组；11分）
根据亚足联安排，12强赛抽签仪式将在4月12日进行。届时12支球队会分成两组，每组前两名直接晋级俄罗斯世界杯决赛圈，两个小组第三决出参加附加赛的球队，胜者和其他大洲的球队争夺另一个世界杯决赛阶段参赛资格。
A组：沙特1-1战平阿联酋之后，以20分高居头名。阿联酋拿到1分后，在6场可用比赛中有11个积分，成为成绩第3好的小组第2。
巴勒斯坦、马来西亚和东帝汶分列A组的3-5名。
B组：澳大利亚5-1大胜约旦，以小组头名晋级。约旦输球后，6场可用比赛只有10分，未能晋级12强赛。
吉尔吉斯斯坦、塔吉克斯坦和孟加拉分列3-5位。
C组：中国队2-0击败卡塔尔，6场可用积分达到了11分，朝鲜和约旦2队落败后只有10分，加上阿曼输给伊朗，中国队成为成绩第4好的小组第2，在半个亚洲的帮忙下奇迹般晋级。
卡塔尔在C组则是提前2轮锁定小组头名位置。中国香港位列第3，马尔代夫和不丹分列4、5位。
D组：伊朗2-0击败阿曼，锁定小组头名。阿曼6场比赛可用积分只有8分，未能出线。
土库曼斯坦、关岛和印度分别3-5位。
E组：日本5-0大胜叙利亚，双杀对手的同时锁定小组第1。叙利亚虽然惨败，但6场比赛有12个可用积分，以成绩第2好的小组第2晋级。
新加坡、阿富汗和柬埔寨分列3-5位。
F组：伊拉克1-0小胜越南，6战积12分，而且手握7个净胜球，超越叙利亚成为成绩最好的小组第2。
同组的泰国则是提前1轮晋级。越南和中华台北位列3、4位，同组的印尼禁赛。
G组：韩国虽然轮空，但已经提前1轮锁定小组头名晋级。黎巴嫩和缅甸1-1战平，但黎巴嫩是成绩最差的小组第2。
H组：乌兹别克斯坦1-0小胜巴林，顺利成为小组头名。朝鲜2-3不敌菲律宾之后，6战积10分且只有1个净胜球，最终未能出线。
菲律宾取胜朝鲜后力压巴林排名小组第3，巴林滑至第5，也门垫底！
